成化十六年十月，为解决盐课征收问题，宪庙批准了户部的建议：令都察院转行巡盐御史严督运司、分司诸职。
每场额课依期完足，如次年正月不完，则场官停俸、杖追；运使、分司十逋其三，亦停俸。
后此各官三年、六年考满，巡盐御史查无宿负，方许起送；九年考满，其课过违年限不完者，查送吏部降二级
叙用。
丁忧事故，亦须定委附近府堂上官查盘交附，方得去任。
岁终，分司开报、运使转达、御史类奏。
稽考有弊，则提问、奏请、追问如律。
并行两淮及长芦、山东、河东、福建等运司，广东、四川等提举司依仿而行，则宿弊可除、国课不亏矣。
通过此则敕令，达成了如下三点：先，以巡盐御史考核运司官吏，使额课依期完足。
此后，督催盐课成为巡盐御史最为主要的职责之一。
其次，受巡盐御史考核的运司官员范围较广，上至运使、分司，下至各场官，均为巡盐御史考核的对象，而巡盐御史也成为了各运司上下官员三、六、九年考核结果的决定者。
最后，巡盐御史不仅拥有考核权，还拥有一定的执法权。
对于未能完成‘额课’的各盐场的盐课司官吏，巡盐御史有权直接‘停俸、杖追’，对于地位较高的运使、分司官员，小事直接停俸，大事则奏闻请旨并追问。
通过此令，巡盐御史获得了对于都转运盐使司上下所有官员的考核权。
长此以往，在巡盐御史拥有考核权之后，运司大小官吏为了自己的仕途，害怕巡盐御史在纠举和考核时与自己为难，不免小心伺候，甚至曲意逢迎。
而在孝庙朝，巡盐御史的权力逐渐稳定了下来。
弘治二年，朝廷令各处巡盐御史稽察各年盐课，至次年六月不完者，官攒、分司官停俸，任内三年不完者递降一级，运使六年不完者，亦是如此，从而重申与明确了巡盐御史的考核权。
巡盐御史依仗自己的考核权，更多地插手盐政事务，不断侵夺原本属于都转运盐使的权力。
例如，巡盐御史孙衍在弘治三年巡盐两淮时，尝浚梁垛，新开运盐河，赈贫灶，清掣割，缉私贩，条教明肃。
正德五年，两淮巡盐御史刘绎上疏《盐法五事》：一曰处置未掣引盐，二曰计处食盐供应，三曰责任地方官司，四曰禁革盐徒源流，五曰斟酌该年引目。
而刘绎所反映的事情和所提出的改进意见，最终得以次第举行。
至此，巡盐御史的权力已经没有很严格的界限了，凡盐场事务，只要巡盐御史认为有必要，均可随意插手。
